公海彩船: 课题组长
姓名:
Tomoyasu Sugiyama助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授
职务:
所在院所:
公海彩船
荣誉称号:
教育经历:
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1993/04—1997/03,日本东北大学,学士
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1997/04—1999/03,日本奈良先端科学技术大公海彩船大学,硕士
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1999/04—2003/03,日本大阪大学,博士
博士后及工作经历:
- 2003/04—2007/12,美国国立卫生研究院,Visiting Fellow
- 2008/01—2013/03,日本筑波大学,助理教授
- 2013/04—2014/03,日本筑波高等研究联盟中心,研究员
- 2014/08—2017/07,美国国立卫生研究院,Research Fellow
- 2017/08—至今, 上海科技大学,公海彩船,助理教授(TENURE-TRACK)
公海彩船: 课题组简介
研究内容:
我们实验室主要研究由液液相分离介导的生物凝聚体功能。我们已经研究了以下几个方面:(1)核内凝聚体卡哈尔体(the Cajal body)如何正向调控细胞的静息期;(2)核内形成核体的RNA结合蛋白如何加速组成型异染色质的形成;以及(3)另一种核内凝聚体——解理体中富集的因子介导的RNA的选择性降解。
公海彩船: 研究成果展示
在之前的工作中,我们研究了RNA干扰(RNAi)如何介导异染色质组装,以及一个组蛋白去乙酰化复合体如何在异染色质处抑制转录发生。之后,我们将研究方向转向核内生物凝聚体,并识别和鉴定了重要的RNA降解复合物,MTREC和EMC。我们惊喜地发现,这个核内RNA降解复合物能够避免单亲二体性的发生(一种两条染色体拷贝来自同一个亲本的遗传现象),这种异常可能导致人类疾病的发生。最近,我们鉴定了粟酒裂殖酵母中的Coilin蛋白同源物,它是卡哈尔体(Cajal body)的组织者,并揭示了Coilin对于细胞静息期的重要性。细胞静息期是一种特殊的细胞周期,细胞不进行分裂但在适当条件下仍能重新进入细胞周期。总之,我们的研究致力于理解真核细胞中核体所承担的角色。
公海彩船: 代表性论文(*第一作者,#通讯作者)
- 1. Deng, Xiaoling*; Yao, Qinglian; Horvath, Attila; Jiang, Ziling; Zhao, Junjie; Fischer, Tamas; Sugiyama, Tomoyasu#; .The fission yeast ortholog of Coilin, Mug174, forms Cajal body-like nuclear condensates and is essential for cellular quiescence.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 01 Jun 公海彩船.
- 2. Wang, Xindi*; Xu, Ruoming; Wang, Yichen; Liu, Ziyue; Lou, Ronghui; Sugiyama, Tomoyasu#; .Yesprit and Yeaseq: Applications for designing primers and browsing sequences for research using the four Schizosaccharomyces species.YEAST. Nov 2021. 38(11):583-591.
- 3. Marayati, Bahjat F.*; Tucker, James F.; De La Cerda, David A.; Hou, Tien-Chi; Chen, Rong; Sugiyama, Tomoyasu; Pease, James B.; Zhang, Ke#; .The Catalytic-Dependent and -Independent Roles of Lsd1 and Lsd2 Lysine Demethylases in Heterochromatin Formation in Schizosaccharomyces pombe.CELLS. Apr 2020. 9(4).
- 4. Taneja, Nitika*; Zofall, Martin; Balachandran, Vanivilasini; Thillainadesan, Gobi; Sugiyama, Tomoyasu; Wheeler, David; Zhou, Ming; Grewal, Shiv I. S.#.SNF2 Family Protein Fft3 Suppresses Nucleosome Turnover to Promote Epigenetic Inheritance and Proper Replication.Molecular Cell. 6 April 2017.
- 5. Folco, H. Diego*; Chalamcharla, Venkata R.; Sugiyama, Tomoyasu; Thillainadesan, Gobi; Zofall, Martin; Balachandran, Vanivilasini; Dhakshnamoorthy, Jothy; Mizuguchi, Takeshi; Grewal, Shiv I. S.#; .Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy.NATURE. 2017. 543(7643):126+.
- 6. Sugiyama, Tomoyasu*; Thillainadesan, Gobi; Chalamcharla, Venkata R.; Meng, Zhaojing; Balachandran, Vanivilasini; Dhakshnamoorthy, Jothy; Zhou, Ming; Grewal, Shiv I. S.#; .Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly.MOLECULAR CELL. 2016. 61(5):747-759.
- 7. Zhou, Yang*; Zhu, Jianguo; Schermann, Geza; Ohle, Corina; Bendrin, Katja; Sugioka-Sugiyama, Rie; Sugiyama, Tomoyasu#; Fischer, Tamas#; .The fission yeast MTREC complex targets CUTs and unspliced pre-mRNAs to the nuclear exosome.NATURE COMMUNICATIONS. 2015. 6.
- 8. Sugiyama, Tomoyasu#*; Wanatabe, Nobuyoshi; Kitahata, Eri; Tani, Tokio; Sugioka-Sugiyama, Rie; .Red5 and three nuclear pore components are essential for efficient suppression of specific mRNAs during vegetative growth of fission yeast.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2013. 41(13):6674-6686.
- 9. Sugiyama, Tomoyasu#*; Sugioka-Sugiyama, Rie; .Red1 promotes the elimination of meiosis-specific mRNAs in vegetatively growing fission yeast.EMBO JOURNAL. 2011. 30(6):1027-1039.
- 10. Sugiyama, Tomoyasu*; Cam, Hugh P.; Sugiyama, Rie; Noma, Ken-ichi; Zofall, Martin; Kobayashi, Ryuji; Grewal, Shiv I. S.#; .SHREC, an effector complex for heterochromatic transcriptional silencing.CELL. 2007. 128(3):491-504.
- 11. Sugiyama, T*; Cam, H; Verdel, A; Moazed, D; Grewal, SIS#; .RNA-dependent RNA polymerase is an essential component of a self-enforcing loop coupling heterochromatin assembly to siRNA production.PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 2005. 102(1):152-157.
- 12. Cam, HP*; Sugiyama, T; Chen, ES; Chen, X; FitzGerald, PC; Grewal, SIS#; .Comprehensive analysis of heterochromatin- and RNAi-mediated epigenetic control of the fission yeast genome.NATURE GENETICS. 2005. 37(8):809-819.
- 13. Verdel, A*; Jia, ST; Gerber, S; Sugiyama, T; Gygi, S; Grewal, SIS#; Moazed, D#; .RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex.SCIENCE. 2004. 303(5658):672-676.
公海彩船: 课题组成员及合影
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姓名:宋修怡
身份:工程师
在组时间:2018/02-至今
邮箱:songxy@@shanghaitech.edu.cn
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姓名:刘子月
身份:博士后
在组时间:2018/01-至今
邮箱:liuzy8@shanghaitech.edu.cn
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姓名:邓小玲
身份:硕士研究生
在组时间:2018/03-至今
邮箱:dengxl@@shanghaitech.edu.cn
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姓名:赵俊杰
身份:博士研究生
在组时间:202103-至今
邮箱:202103-至今
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姓名:杨荣添
身份:硕士研究生
在组时间:公海彩船02-至今
邮箱:yangrt2022@@shanghaitech.edu.cn
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姓名:郭欣宇
身份:硕士研究生
在组时间:公海彩船02-至今
邮箱:guoxy2022@@shanghaitech.edu.cn
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