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公海彩船:杨贝, PhD助理教授 研究员 博士生导师

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邮箱: yangbei@@shanghaitech.edu.cn

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地址: 上海市浦东新区华夏中路393号人字楼B405室

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病原生物学实验室

公海彩船: 课题组长

姓名:

杨贝助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授

职务:

所在院所:

公海彩船、免疫化学研究所

荣誉称号:

教育经历:
  • 2000/09—2004/06,武汉大学生物学基地班,学士
  • 2004/09—2010/07,中国科公海彩船上海生物化学与细胞生物学研究所,博士
博士后及工作经历:
  • 2010/08—2013/06,美国国立健康研究院,博士后
  • 2013/07—2015/07,美国加州大学伯克利分校,博士后
  • 2015/11—2020/09,上海科技大学免疫化学研究所,副研究员
  • 2020/10—至今,上海科技大学公海彩船、免疫化学研究所,研究员, 助理教授(TENURE-TRACK)

公海彩船: 课题组简介

研究方向:
感染性疾病与遗传性罕见病
研究内容:

实验室综合运用包括整合结构生物学、生物大分子质谱、基因编辑等在内的前沿技术体系,结合多种体外、体内评估手段,致力于解决具有临床意义的重要生物学问题。现阶段,本实验室主要针对一系列高风险传染性疾病(如艾滋病、疟疾等)以及遗传性罕见病(如地中海贫血、高血脂症等)开展分子病理机制方向的探索,并致力于针对这些疾病鉴定新型治疗靶点开发相应的预防新手段(如新型疫苗)与治疗新方法(如基因治疗)。我们鼓励学生进行原创性探索、发展批判性思维,也致力于为各位同学提供自由的学术氛围和了解掌握不同前沿技术的机会。


课题组网站:

公海彩船: 研究成果展示

近期科研成果:

1、位于HIV-1病毒表面的Env蛋白三聚体是艾滋病疫苗研发的焦点。我们报道了我国HIV-1病毒的主流亚型(即流行重组亚型CRF01_AECRF07_BC)的Env蛋白结构与免疫识别特征,揭示了CRF01_AE亚型的Env蛋白在V1区域的独有特征(图A-B)及其与该亚型的广谱中和抗体逃逸能力之间的关系(图C-D),并阐明了第一株分离自CRF01_AE感染个体的广谱中和抗体的新型中和机制(图E)。该研究拓宽了我们对于HIV-1流行重组亚型的认识,为后续针对我国主流HIV-1亚型开展免疫聚焦型疫苗设计和相关广谱中和抗体的应用开发提供了理论依据 (发表于 Nat. Commun., 公海彩船)。 

2、通过对基因编辑工具蛋白进行结构指导的工程改造,我们参与创建并优化了多种精准高效的新型基因编辑(包括碱基编辑与导向编辑)系统(分别发表于 Cell Res., 2017; Nat. Biotechnol., 2018a; Nat. Biotechnol., 2018b; Cell Rep., 2020; Nat. Cell Biol., 2021; Nat. Commun., 2022)。目前,我们已初步探索了导向编辑技术在高风险传染性疾病的预防方向的应用潜力(发表于 Medcomm., 公海彩船),正与合作者一同推动新型碱基编辑技术在遗传性疾。ㄈ绲刂泻F堆、高血脂症等)治疗中的实际应用(部分临床前成果发表于 Cell Stem Cell, 公海彩船)。


3、我们发掘了人冠状病毒刺突蛋白的HR1基序作为广谱抗冠状病毒作用靶点的潜力(发表于 Acta Crystallogr. D, 2018),并在此基础上与合作者共同开发出了一种广谱抗冠状病毒抑制肽(发表于 Sci. Adv., 2019)。该抑制肽作为HR2基序的模拟物,以HR1基序为靶点,在动物实验中对多种人冠状病毒的感染表现出较好的抑制效果。在上述工作的基础上,我们继续描绘了α属冠状病毒刺突蛋白的抗原图谱,揭示了不同属的人冠状病毒的刺突蛋白之间在抗原特性上的共性与差异,为开发广谱冠状病毒疫苗提供了理论信息(发表于 Commun. Biol., 2022)。

4、3C蛋白是肠道病毒属(Enterovirus)病毒药物开发的热点之一。我们发现,3C蛋白除具有传统的蛋白酶功能外还在该属病毒的基因组复制过程中发挥了关键调控作用,并鉴定出了3C蛋白上负责与病毒基因组结合的全新可靶向位点。该新靶点具有很高的病毒属内保守性,可望用于指导后续针对该属病毒的广谱抑制剂研发工作(发表于PNAS, 2020)。目前,我们正在针对这一新可靶位点开展小分子化合物的筛选与验证工作。

 


公海彩船: 代表性论文(*第一作者,#通讯作者)

公海彩船: 专著

公海彩船: 专利

公海彩船: 项目

  • 1. 上海市浦江人才项目,上海市科学技术委员会,项目负责人
  • 2. 国家自然科学基金青年项目,国家自然科学基金委,项目负责人
  • 3. 2021-国家自然科学基金面上项目,国家自然科学基金委,项目负责人
  • 4. 国家重点研发计划 ,中华人民共和国科技部,课题参与人员(非负责人)
  • 5. 国家科技重大专项‘艾滋病疫苗研究’,中华人民共和国科技部,课题参与人员(非负责人)
  • 6. 公海彩船-上海市公海彩船年度“科技创新?动计划” ?上项?,上海市科学技术委员会,项目负责人

公海彩船: 奖励

  • 1. 2016年,浦江人才
  • 2. 2020、2021、2022,上海科技大学优秀教师
  • 3. 2020,中国性病艾滋病防治协会,艾滋病病毒学专业委员会委员

公海彩船: 加入我们

公海彩船: 课题组成员及合影

  • 姓名:戚琪莲
    身份:工程师
    在组时间:2016/01-至今
    邮箱:qiql@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:张仙芳
    身份:工程师
    在组时间:2016/07-至今
    邮箱:zhangxf1@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:张轩
    身份:博士研究生
    在组时间:2018-至今
    邮箱:zhangxuan@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:赵文文
    身份:硕士研究生
    在组时间:2019-至今
    邮箱:zhaoww@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:孙尚武
    身份:硕士研究生
    在组时间:2020-至今
    邮箱:sunshw@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:王琪
    身份:硕士研究生
    在组时间:2020-至今
    邮箱:wangqi3@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:罗雅心
    身份:硕士研究生
    在组时间:2021-至今
    邮箱:luoyx1@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:周宇
    身份:硕士研究生
    在组时间:2021-至今
    邮箱:zhouyu3@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:朱梦尧
    身份:硕士研究生
    在组时间:2021-至今
    邮箱:zhumy@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:候耀峰
    身份:硕士研究生
    在组时间:2022-至今
    邮箱:houyf2022@shanghaitech.edu.cn


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